民主進步黨主席游錫堃於三月八日登記完成後,向黨中央請假,主席職務委請民進黨中常委蔡同榮暫時代理,卻遭到部份媒體與黨內同志指稱不符代理程序,民主進步黨秘書長林佳龍表示,游主席目前是請假,主席職務並非出缺,因此指定職務代理人實屬正常,請外界不必要作過多的解讀。
林佳龍秘書長強調,過去陳總統在擔任民進黨主席時,如果是遇到出國行程或是無法開會,為了讓中常會議事順利進行,陳總統曾指派當時的秘書長張俊雄來代理主持中常會,過去游主席請假時,也曾經請呂秀蓮副總統與謝長廷前院長來代理主持中常會,因此黨主席請假時指定代理人,在民進黨內有前例可循。
另外,有部分黨員認為,游主席請假之後,若由蔡同榮中常委暫時代理黨主席,將可能影響不分區立委排名時的公平性,對此林佳龍秘書長強調,不分區立委的提名,是在總統候選人與區域立委產生之後才會出現,目前黨主席職務由蔡同榮中常委暫代,並不會影響不分區立委的提名。同時,蔡同榮中常委是民進黨內相當資深的同志,也非常熟悉黨務的運作,因此由蔡同榮中常委代理主席之職務並無不當之處。