針對前陸委會主委蘇起批評蔡英文是兩獨的幫兇,民進黨副秘書長李應元表示,蘇起的批評失去學者的風範,兩獨說不像是出自讀書人之口,對於兩岸關係,蘇起有不同的主張,我們都可以尊重,但是,用惡毒的口氣罵人,這不是討論問題的態度。如果這些批評是出現在人民日報或者新華社,我們一點都不會驚訝,但是出自於蘇起之口,我們覺得不可思議。
李應元表示,蔡英文對於兩岸關係的專業知識,眾所皆知,她擔任陸委會主委期間,中共對於民進黨執政的事實,一開始也很難面對,但是,蔡英文主委在維護國家主權尊嚴、保持台海和平穩定、擴大兩岸經貿交流工作,一直處理得很好,立法院不分黨派的立委評價也很高,這是蘇起沒有辦法抹煞的。
針對兩國論風波,李應元表示,蘇起擔任陸委會主委,就應該要有政務官的擔當,而蔡英文當時只是總統幕僚,當然不需要擔負政治責任,蘇起的批評令人遺憾。同時,如果蘇起的理念與李登輝總統不同,要如何擔任李總統時代的政務官?這是令人不解的。
李應元說,蘇起現在的言論,幾乎是以政治立場來論斷所有的事情,甚至要否定李登輝時代的一切。李應元說,民進黨政府什麼時候獨裁了?蘇起亂扣帽子的說法,實在令人很難接受。如果國民黨提名蘇起出任不分區立委,大家以後可以比較一下,到底誰的專業程度比較好、誰的見解比較受到民意的支持。